按照综合预算的原则，部门所有收入和支出均纳入预算管理。2018年，福建省审计厅部门收入预算为8475.54万元，比上年减少1031.82万元，主要原因是单位结转结余资金减少。其中：一般公共预算拨款7640.26万元，其他收入238.2万元，单位结余结转资金597.08万元。相应安排支出预算8475.54万元，比上年减少1031.82万元，其中：人员支出4084.34万元，对个人和家庭补助支出363.3万元，公用支出1002.16万元，项目支出3025.74万元。